Η Αυτοδιοίκηση αποτελεί ένα θεσμό που διαδραματίζει ολοένα και πιο ουσιαστικό ρόλο σε εθνικό και ευρωπαϊκό επίπεδο. Θεσμοθετημένη μορφή τοπικής δημοκρατίας και φορέας υλοποίησης πολιτικών σε σημαντικούς τομείς που άπτονται της καθημερινότητας των πολιτών, η Αυτοδιοίκηση αποτελεί ωστόσο συχνά αντικείμενο παρερμηνειών αναφορικά με τις αρμοδιότητες και το ρόλο της. Το μάθημα «Περιφερειακή και Τοπική Αυτοδιοίκηση και Διακυβέρνηση» αποτελεί μια εισαγωγή στη θεωρία και στην πράξη της Αυτοδιοίκησης στην Ελλάδα και στην Ευρώπη. Ξεκινά με την παρουσίαση του θεωρητικού υπόβαθρου του θεσμού της Αυτοδιοίκησης εξετάζοντας τις κύριες θεωρίες θεσμικής αρχιτεκτονικής που διατυπώθηκαν σε χώρες της Δύσης από τον 18ο αιώνα κι έπειτα. Στη συνέχεια, εστιάζει στη διαμόρφωση του Ευρωπαϊκού Χάρτη Τοπικής Αυτονομίας, εξετάζει επιμέρους διατάξεις του και μελετά το ρόλο του Κογκρέσου Τοπικών και Περιφερειακών Αρχών του Συμβουλίου της Ευρώπης και της Ευρωπαϊκής Επιτροπής Περιφερειών. Σημαντικό μέρος του μαθήματος αφιερώνεται, τέλος, στην επισκόπηση του Προγράμματος Καλλικράτης και στην περιγραφή επιμέρους αρμοδιοτήτων που έχει εκχωρήσει στους ΟΤΑ πρώτου και δεύτερου βαθμού.